Bionic Visualizations

Proteomaps
Proteomaps show the quantitative composition of proteomes. Each protein is represented by a polygon: areas reflect protein abundance, and functionally related proteins are arranged in common and similarly colored regions. For further reading please see www.proteomaps.net
organism?
comment?
tsv file?
browse
or data?
Insert an example?
Please consider!
cushioning?
E gltS
Escherichia coli
E gltS
17705289767478
WT E
Escherichia coli
WT E
17705289483616
no comment
Homo sapiens (Human)
no comment
17702169860246
A-P liver down 10%
Mus musculus (Mouse)
A-P liver down 10%
17701223302985
A-P liver up 10%
Mus musculus (Mouse)
A-P liver up 10%
17701223026255
no comment
Homo sapiens (Human)
no comment
17683350945296
no comment
Arabidopsis thaliana (Mousear cress)
no comment
17676392922616
no comment
Arabidopsis thaliana (Mousear cress)
no comment
17676392534336
no comment
Arabidopsis thaliana (Mousear cress)
no comment
17676389342143
no comment
Arabidopsis thaliana (Mousear cress)
no comment
17676300172395
organism?
comment?
tsv file?
browse
or data?
Insert an example?
Please consider!
cushioning?
no comment
Mus musculus (Mouse)
no comment
17727090800672
no comment
Mus musculus (Mouse)
no comment
17726431782559
no comment
Homo sapiens (Human)
no comment
17726357111826
no comment
Homo sapiens (Human)
no comment
17726354389305
no comment
Mus musculus (Mouse)
no comment
17726207461126
no comment
Mus musculus (Mouse)
no comment
17726207461125
no comment
Homo sapiens (Human)
no comment
17725701779235
no comment
Homo sapiens (Human)
no comment
17725444702567
Retention time (min) 0.684216666666667 10.8655666666667 10.8655666666667 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.684216666666667 0.684216666666667 0.684216666666667 9.33326666666667 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 6.06596666666667 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 4.0906 4.32701666666667 4.32701666666667 3.91773333333333 0.4775 3.78256666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 3.85013333333333 7.49281666666667 7.49281666666667 7.49281666666667 7.49281666666667
Aliivibrio fischeri ES114
Retention time (min) 0.684216666666667 10.8655666666667 10.8655666666667 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.684216666666667 0.684216666666667 0.684216666666667 9.33326666666667 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 6.06596666666667 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 4.0906 4.32701666666667 4.32701666666667 3.91773333333333 0.4775 3.78256666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 3.85013333333333 7.49281666666667 7.49281666666667 7.49281666666667 7.49281666666667
17724466173741
Retention time (min) 0.684216666666667 10.8655666666667 10.8655666666667 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.684216666666667 0.684216666666667 0.684216666666667 9.33326666666667 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 6.06596666666667 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 4.0906 4.32701666666667 4.32701666666667 3.91773333333333 0.4775 3.78256666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 3.85013333333333 7.49281666666667 7.49281666666667 7.49281666666667 7.49281666666667
Aliivibrio fischeri ES114
Retention time (min) 0.684216666666667 10.8655666666667 10.8655666666667 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 10.8993833333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.650433333333333 0.684216666666667 0.684216666666667 0.684216666666667 9.33326666666667 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 0.4775 6.06596666666667 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 8.31168333333333 4.0906 4.32701666666667 4.32701666666667 3.91773333333333 0.4775 3.78256666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 7.35766666666667 3.85013333333333 7.49281666666667 7.49281666666667 7.49281666666667 7.49281666666667
17724466173740
Before setting up an individual treemap template these issues need to be considered.
treemap name?
upload tmd file?
browse
edit tmd data?
Insert an example?
source?
db link?
comment?
user name?
user template previews
Drive targeted traffic to your website with our AI-powered solution, costing far less than expensive paid advertising. Connect with us to boost your results.<br /><br />https://cutt.ly/7tQitrMN
Shasta Skeens
Drive targeted traffic to your website with our AI-powered solution, costing far less than expensive paid advertising. Connect with us to boost your results.

https://cutt.ly/7tQitrMN
17724956321508
no comment
VAtest (adapted by L 01032026)
no comment
17723897989527
no comment
V.album 250226 season (adapted by L 25022026)
no comment
17720382251030
no comment
Eubacterium limosum
no comment
17694827072328
no comment
Eubacterium Limosum
no comment
17694822520491
just simple test with DK
SB_KMAR_v1_01-14-2026
just simple test with DK
17684218848679
no comment
DK_VANPO_template_v3 (adapted by D 14012026)
no comment
17684130916293
no comment
enteroccocus faecalis (adapted by U 22122025)
no comment
17664314612752
no comment
VA season (adapted by L 18122025)
no comment
17660494360004
no comment
Viscum album season
no comment
17660491933389
organism?
comment?
tsv file?
browse
or data?
Insert an example?
Please consider!
cushioning?
C1
VAtest (adapted by L 01032026)
C1
17723911990843
CL10
V.album 250226 season (adapted by L 25022026)
CL10
17720982455032
CL9
V.album 250226 season (adapted by L 25022026)
CL9
17720982246268
CL8
V.album 250226 season (adapted by L 25022026)
CL8
17720982034765
CL7
V.album 250226 season (adapted by L 25022026)
CL7
17720981797640
CL6
V.album 250226 season (adapted by L 25022026)
CL6
17720981595974
CL5
V.album 250226 season (adapted by L 25022026)
CL5
17720981394651
CL4
V.album 250226 season (adapted by L 25022026)
CL4
17720981198343
CL3
V.album 250226 season (adapted by L 25022026)
CL3
17720980836900
CL2
V.album 250226 season (adapted by L 25022026)
CL2
17720980197184
This website and the underlying treemap algorithm is provided for non profit research or/and academic organisations only.
The space proportional algorithm for the generation of Voronoi Treemaps has been implemented within the DFG Research Initiative SFB Transregio34 Z1.
For commercial applications please contact DECODON.
For individual access please set up a collaboration within academic research efforts with Jörg Bernhardt.
The idea of comparable treemaps for different biological species was born in Dec 2012 in a collaborative effort of Ron Milo, Weizmann Institute of Science; Wolfram Liebermeister, Charité - Universitätsmedizin Berlin and Jörg Bernhardt, Universität Greifswald.

If you have used Proteomaps for your research please cite:
Liebermeister W., Noor E., Flamholz A., Davidi D., Bernhardt J., and Milo R. (2014), Visual account of protein investment in cellular functions, PNAS 111 (23), 8488-8493.
Otto, A., Bernhardt, J., Meyer, H., Schaffer, M., Herbst, F.-A., Siebourg, J., Mäder, U., Lalk, M., Hecker, M., and Becher, D. (2010). Systems-wide temporal proteomic profiling in glucose-starved Bacillus subtilis.Nature Communications 1, 137.
Bernhardt J, Funke S, Hecker M, Siebourg J (2009) in Sixth International Symposium on Voronoi Diagrams, pp 233-241.
Privacy Policy